BIOVIA Discovery Studio به عنوان نسخه اصلی BIOVIA برای علوم پیشگویی و مدل سازی و شبیه سازی در علوم زندگی است. BIOVIA Discovery Studio شامل برنامه شبیه سازی بسیار کارآمد مکانیک مولکولی CHARMm است. با بیش از 30 سال بررسی دقیق تحقیقات دانشگاهی CHARMm با تمرکز اصلی بر مطالعه پروتین ها, پپتاید, لیگاندهای مولکول های کوچک, اسیدهای نوکلئیک, لیپیدها و کربوهیدرات ها ایجاد شده است. برای مطالعات مبتنی بر مکانیک کوانتومی, این نرم افزار شامل برنامه DMol3 میباشد. DMol3 یک برنامه DFT با رکورد طولانی برنامه های تجاری موفق میباشد. DMol3 با استفاده از رویکرد منحصر به فرد خود برای حل معادلات مکانیکی کوانتومی یکی از سریعترین روش های موجود برای انجام محاسبات است و نکات مثبتی را برای سیستم های بزرگتر به ارمغان میاورد.
ویژگی های نرم افزار BIOVIA Discovery Studio:
محاسبات مکانیک مولکولی (MM) با استفاده از CHARMm c41b1
پشتیبانی از طیف گسترده ای از زمینه های نیرو، از جمله CGenFF, charmm36, charmm27, charmm22, CHARMm, CHARMm-polarH, CFF, MMFF و بیشتر
پشتیبانی کامل از مکانیزم پارتیشن CHARMM و پشتیبانی از تعریف نامعتبر سفارشی
یونیزاسیون سریع و دقیق پروتئین و pKs باقی مانده را با استفاده از مدل حلال CHARMm متولد شده (GB) انجام دهید
روش سریع حلال آب آشامیدنی با ضد یون های اختیاری مناسب برای سیستم های بسیار بزرگ مولکولی
انجام هر یک از حلال صریح یا به حداقل رساندن مکانیک مولکولی (MM) مبتنی بر حلال بر اساس GB
انجام یک حلال صریح یا شبیه سازی مولکولی دینامیک مبتنی بر حلال
یک غشاء ضمنی را به ساختار پروتئین اضافه کنید تا بتوانید مدلهای شبیه سازی را بر اساس نیروی فیلد تدوین کنید
از CDOCKER , یک موتور داکینگ مبتنی بر CHARMm برای انجام پیوند انعطاف پذیر مبتنی بر لیگاند و پالایش داکینگ استفاده کنید.
به روز رسانی :
98/09/17 نسخه v16.1.0 اضافه شد.
سلام
وقت بخیر
فایل ها حذف شدن؟ امکان داره دوباره قرار داده بشن؟
با تشکر
سلام
لطفا مجددا فایلهای بازی را بررسی کنید . لینک ها مشکلی ندارند.
با سلام.
برنامه BIOVIA Pipeline Pilot رو گذاشتین.
لطفآ اصلاح کنید و فایلهای برنامه discovery studio رو بگذارید ممنون.